ABSTRAKTA – 15. kongres Praktického lékárenství

15 PÁTEK / 18. 6. 2021 / 16.50–18.20 hod. Covid-19 mezioborově Sars‑CoV-2 pohledemmikrobiologa Mgr. Taťána Štosová, Ph.D. Ústav mikrobiologie, Fakultní nemocnice Olomouc Jako původce současné pandemie byl v lednu 2020 potvrzen nový koronavirus, který byl pojmenován Sars‑CoV-2. Stal se sedmým lidským koronavirem, který způsobuje onemocnění dnes nazývané covid-19. Sars‑CoV-2 byl na základě bio­ informatických analýz zařazen do rodu betacoronavirus podrodu Sarbecovirus a ze získaných sekvencí genomu a jejich srovnání se přikláníme k tomu, že se mohl přirozeně vyvinout z koronaviru vyskytujícího se u netopýrů (Cov RaTG13). Jedná se o obalený RNA virus s pozitivním jednořetězcovým genomem. Jeho celá genomová sekvence byla poprvé zveřejněna 5. ledna 2020. Tato neuvěři­ telná rychlost umožnila zareagovat na řešení stále se zvětšujícího problému. Díky informacím o stavbě genomu mohl být rychle spuštěn výzkum vakcín a diagnostických souprav. Celosvětově byly pro diagnostiku covidu-19 navr­ ženy různé protokoly PCR v reálném čase, které se lišily v genech, jež detekují. WHO rovněž vydala doporučení odběru vyšetřovaného materiálu a vyhodno­ cování laboratorních vyšetření. Mikrobiologické laboratoře, které se zařadily do testování vzorků pacientů na přítomnost viru Sars‑CoV-2, musely zásadně změnit a přizpůsobit svůj dosavadní provoz. Ve velice krátkém čase musely změnit organizaci práce s ohledem na nárůst počtu vyšetření za účelem prů­ kazu patogenu Sars‑CoV-2. Bylo nutné optimalizovat metody a zajistit, že se klinickým lékařům dostane jednoznačný a spolehlivý výsledek v co nejkratším čase. Kromě samotné laboratorní práce bylo nutné zapojit se do různých sys­ témů hlášení, spolupráce s hygienickými stanicemi a v neposlední řadě rovněž spolupracovat s lékaři v primární péči. I v době pandemie musí mikrobiologic­ ké laboratoře zachovat vyšetřování všech dalších patogenů v nezměněném rozsahu. V současné době se spektrum metod zacílené na Sars‑CoV-2 značně rozšířilo a je potřeba větší obezřetnosti v interpretaci získaných výsledků. Genom koronaviru je jedním z největších mezi RNA viry a je přirozené, že se i u něj vyskytují různé variace. Při podrobnějším studiu se zjistilo, že koro­ navirus mutuje relativně pomalu ve srovnání s jinými RNA viry. Je to částečně proto, že je svým aparátem schopen opravit některé chyby. Nicméně s využitím statistického přepočtu se dají očekávat přibližně dvě významnější substituce v genomu za měsíc. Změny v genetické informaci mají různou důležitost. Oba­ vy jsou zejména z takových změn, které by mohly přispět k rozdílům přeno­ sitelnosti, infekčnosti, závažnosti onemocnění covid-19 a případně prolomení imunity získané očkováním. Jedinou metodou, která může tyto změny sledovat a zaznamenávat, je celogenomové sekvenování. Tyto analýzy jsou však již nad rámec rutinních možností klinických mikrobiologických laboratoří. Přednáška byla nahrána na 16. konferenci Interní medicína pro praxi 30. 4. 2021 15. KONGRES PRAKTICKÉHO LÉKÁRENSTVÍ 18. 6. – 30. 9. 2021 / ON-LINE ABSTRAKTA